Phương pháp chụp cấu trúc nhiễm sắc thể (3C) dựa trêntiết lộ tổ chức nhiễm sắc thể trong nhân bằng cách xác định sự gần gũi vật lý của các cặp điểm dọc theo chất nhiễm sắc. Chúng bảo tồn các tương tác nhiễm sắc bằng cách liên kết chéo, sau đó là sự phân mảnh, thắt chặt và sắp xếp trình tự của các vùng tương tác.
Việc thu thập cấu trúc nhiễm sắc thể hoạt động như thế nào?
Chụp cấu trúc nhiễm sắc thể trên chip (4C)chụp tương tác giữa một locus và tất cả các locus gen khác. Nó liên quan đến bước thắt thứ hai, để tạo ra các đoạn DNA tự tuần hoàn, được sử dụng để thực hiện PCR ngược. … Trên một microarray, có thể phân tích khoảng một triệu tương tác.
Chụp cấu trúc nhiễm sắc là gì?
Chromatin Conformation Capture (3C) làmột kỹ thuật quan trọng được sử dụng để nghiên cứu cấu trúc nhiễm sắc, cũng như cơ sở cho một số kỹ thuật dẫn xuất khác. … Quy trình liên quan đến việc liên kết chéo formaldehyde của các tế bào, sau đó là phân lập và phân hủy nhiễm sắc chất bằng một loại enzyme hạn chế.
Trình tự Hi-C hoạt động như thế nào?
Phương pháp Hi-C mở rộng3C-Seq để lập bản đồ các điểm tiếp xúc nhiễm sắc thể trên toàn bộ bộ gen, và nó cũng đã được áp dụng để nghiên cứu các tương tác nhiễm sắc tại chỗ. Trong phương pháp này, phức hợp DNA-protein được liên kết chéo với formaldehyde. Mẫu được phân mảnh, và DNA được chiết xuất, uốn nếp và tiêu hóa bằng các enzym giới hạn.
Kỹ thuật Hi-C là gì?
Kỹ thuật Hi-C cổ điển liên quan đến việc tiêu hóa giới hạncủa bộ gen liên kết chéo với formaldehyde với các enzym giới hạn cụ thể theo trình tự, tiếp theo là điền vào và sửa chữa các đầu đã tiêu hóa bằng cách kết hợp các nucleotide liên kết biotin. Các đầu được sửa chữa sau đó sẽ được xếp lại.
